Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ49

NEU3, Sialidase-3, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEU3Q9UQ49 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NEU3Q9UQ49 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NEU3Q9UQ49 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.3 ms