Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMG5Q9UPR3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMG5Q9UPR3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms