Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN37

VPS4A, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS4AQ9UN37 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
VPS4AQ9UN37 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms