Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX12Q9UMY4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms