Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS6

SYNPO2, Synaptopodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNPO2Q9UMS6 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SYNPO2Q9UMS6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SYNPO2Q9UMS6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms