Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS4

PRPF19, Pre-mRNA-processing factor 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF19Q9UMS4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
PRPF19Q9UMS4 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PRPF19Q9UMS4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms