Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
INO80Q9ULG1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.73■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC31.72■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC31.72■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.7■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
INO80Q9ULG1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms