Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CFAP45Q9UL16 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms