Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD1

GMEB2, Glucocorticoid modulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMEB2Q9UKD1 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GMEB2Q9UKD1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GMEB2Q9UKD1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms