Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RCAN3Q9UKA8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RCAN3Q9UKA8 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms