Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
RPUSD1Q9UJJ7 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms