Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIG8

SLCO3A1, Solute carrier organic anion transporter family member 3A1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO3A1Q9UIG8 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLCO3A1Q9UIG8 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SLCO3A1Q9UIG8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms