Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CYTH4Q9UIA0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CYTH4Q9UIA0 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms