Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GPN3Q9UHW5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPN3Q9UHW5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPN3Q9UHW5 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPN3Q9UHW5 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
GPN3Q9UHW5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms