Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL0

DDX25, ATP-dependent RNA helicase DDX25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX25Q9UHL0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DDX25Q9UHL0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DDX25Q9UHL0 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms