Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHORDC1Q9UHD1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CHORDC1Q9UHD1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms