Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU7

DBF4, Protein DBF4 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBF4Q9UBU7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
DBF4Q9UBU7 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
DBF4Q9UBU7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms