Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
PPARGC1AQ9UBK2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PPARGC1AQ9UBK2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms