Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL13Q9P2N7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL13Q9P2N7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms