Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
RRBP1Q9P2E9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
RRBP1Q9P2E9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms