Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CHPF2Q9P2E5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHPF2Q9P2E5 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CHPF2Q9P2E5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms