Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CHD7Q9P2D1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CHD7Q9P2D1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CHD7Q9P2D1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms