Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CNTN3Q9P232 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN3Q9P232 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms