Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y6

PHRF1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHRF1Q9P1Y6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PHRF1Q9P1Y6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
PHRF1Q9P1Y6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHRF1Q9P1Y6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms