Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LMCD1Q9NZU5 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LMCD1Q9NZU5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms