Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GGA3Q9NZ52 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms