Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYC9

DNAH9, Dynein heavy chain 9, axonemal, humanhuman

Predictions only

Length 4,486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAH9Q9NYC9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DNAH9Q9NYC9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DNAH9Q9NYC9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms