Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SLC5A4Q9NY91 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SLC5A4Q9NY91 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms