Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BARHL2Q9NY43 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BARHL2Q9NY43 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BARHL2Q9NY43 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms