Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY27

PPP4R2, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R2Q9NY27 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PPP4R2Q9NY27 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PPP4R2Q9NY27 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms