Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX78

TMEM260, Transmembrane protein 260, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260Q9NX78 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM260Q9NX78 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM260Q9NX78 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms