Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB20Q9NX57 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB20Q9NX57 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms