Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PDS5BQ9NTI5 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.46
PDS5BQ9NTI5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PDS5BQ9NTI5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.8 ms