Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
DUOX2Q9NRD8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.45■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
DUOX2Q9NRD8 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
DUOX2Q9NRD8 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms