Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR96

TLR9, Toll-like receptor 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR9Q9NR96 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TLR9Q9NR96 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TLR9Q9NR96 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms