Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR80

ARHGEF4, Rho guanine nucleotide exchange factor 4, humanhuman

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Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF4Q9NR80 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARHGEF4Q9NR80 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARHGEF4Q9NR80 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
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