Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SEC31BQ9NQW1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SEC31BQ9NQW1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SEC31BQ9NQW1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms