Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT5

EXOSC3, Exosome complex component RRP40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC3Q9NQT5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
EXOSC3Q9NQT5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
EXOSC3Q9NQT5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms