Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD87

C6orf50, Putative uncharacterized protein C6orf50, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf50Q9HD87 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
C6orf50Q9HD87 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
C6orf50Q9HD87 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms