Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU0

CD248, Endosialin, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD248Q9HCU0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD248Q9HCU0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD248Q9HCU0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms