Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
KIAA1549Q9HCM3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
KIAA1549Q9HCM3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms