Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PLXNA4Q9HCM2 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PLXNA4Q9HCM2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms