Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CENPJQ9HC77 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
CENPJQ9HC77 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CENPJQ9HC77 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms