Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ELP3Q9H9T3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ELP3Q9H9T3 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ELP3Q9H9T3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ELP3Q9H9T3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ELP3Q9H9T3 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ELP3Q9H9T3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ELP3Q9H9T3 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ELP3Q9H9T3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ELP3Q9H9T3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms