Protein–RNA interactions for Protein: Q9H649

NSUN3, tRNA (cytosine(34)-C(5))-methyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN3Q9H649 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NSUN3Q9H649 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NSUN3Q9H649 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms