Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SDCBP2Q9H190 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SDCBP2Q9H190 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms