Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HOXD1Q9GZZ0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HOXD1Q9GZZ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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