Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
CCDC90BQ9GZT6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CCDC90BQ9GZT6 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms