Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR1EQ9GZS1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR1EQ9GZS1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms