Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PDGFDQ9GZP0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PDGFDQ9GZP0 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PDGFDQ9GZP0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms